Tgħallem dwar siRNA u Kif tintuża

Ħares lejn l-RNA Żgħir li Tinterferixxi u Użi fir-Riċerka dwar il-Ġenetika Molekulari

Opabinia regalis / Wikimedia Commons

siRNA, li jfisser l-Aċidu Ribonukleiku li jinterferixxi ż-żgħir, huwa klassi ta 'molekuli ta' RNA ta 'ċelluli doppji. Xi drabi huwa magħruf bħala RNA ta 'interferenza qasir jew RNA ta' sajlenser.

Qabel ma tgħaddas f'liema eżattament hi siRNA, huwa importanti li tkun taf il-funzjoni ta 'l-RNAs. L-Aċidu Ribonukleiku (RNA) huwa aċidu nukleiku preżenti fiċ-ċelluli ħajjin kollha u jaġixxi bħala messenger li jġorr struzzjonijiet minn DNA biex jikkontrolla s-sintesi ta 'proteini (nota: f'xi viruses RNA aktar milli DNA ġġorr ukoll l-informazzjoni ġenetika).

L-RNA li jinterferixxi iż-żgħar (siRNA) huma biċċiet żgħar ta 'RNA double-stranded (ds), normalment madwar 21 nucleotide long, bi 3' overhangs (2 nucleotides) f'kull tarf li jistgħu jintużaw biex "jinterferixxu" mat-traduzzjoni ta 'proteini billi jorbtu għal u l-promozzjoni tad-degradazzjoni tal-RNA tal-messaġġier (mRNA) f'sezzjonijiet speċifiċi.

Meta tagħmel dan, siRNA jipprevjeni l-produzzjoni ta 'proteini speċifiċi bbażati fuq is-sekwenzi nukleotidi tal-mRNA korrispondenti tagħhom. Il-proċess jissejjaħ interferenza RNA (RNAi), u jista 'jissejjaħ ukoll siRNA silencing jew siRNA knockdown.

Minn fejn ġejjin minn

siRNA huma ġeneralment ikkunsidrati li ġew minn linji itwal ta 'tkabbir eżoġenu jew li joriġinaw minn barra organiżmu) RNA li jittieħed miċ-ċellola u jgħaddi minn proċessar ulterjuri.

L-RNA ta 'spiss jiġi minn vectors , bħal viruses jew transposons, u nstab li għandhom rwol fid-difiża antivirali, degradazzjoni ta' mRNA li jkun prodott iżżejjed jew mRNA li għalih ġiet imwaqqfa t-traduzzjoni, u li tipprevjeni tfixkil tad-DNA ġenomiku permezz ta 'transposons.

Kull linja ta 'siRNA għandha 5' grupp fosfat u grupp 3 'hydroxyl (OH). Dawn huma prodotti minn dsRNA jew hairpin looped RNA li, wara li tidħol ċellula hija maqsuma minn enzima bħal RNase III, imsejħa Dicer , bl-użu ta 'RNase jew enżimi ta' restrizzjoni . Is-siRNA mbagħad jiġi inkorporat fi grupp ta 'proteini b'ħafna sotto-unitajiet imsejjaħ kumpless ta' sajlenser ikkawżat minn RNAi (RISC).

RISC ifittex "mRNA immirat xieraq, fejn is-siRNA imbagħad jbiddel u, huwa maħsub, il-linja antisense tmexxi d-degradazzjoni tal-linja kumplimentari ta 'mRNA, billi tuża taħlita ta' endożi endo- u exonuclease.

Użi Mediċi u Terapewtiċi

Meta ċellula tal-mammiferi tħabbat wiċċha ma 'RNA bi strand doppju bħal siRNA, jista' jiżbaljaha bħala prodott sekondarju virali u jibda rispons immuni. Barra minn hekk, l-introduzzjoni ta 'siRNA jista' jikkawża off-targeting mhux intenzjonat fejn proteini oħra li ma jheddux jistgħu wkoll jiġu attakkati u eliminati.

L-introduzzjoni ta 'siRNA wisq għall-ġisem tista' tirriżulta f'avvenimenti mhux speċifiċi minħabba l-attivazzjoni ta 'rispons immuni intrinsiku, iżda minħabba l-abbiltà li tħabbat kwalunkwe ġene ta' interess, siRNAs għandhom il-potenzjal għal ħafna użi terapewtiċi.

Permezz ta 'modifika kimika ta' siRNAs biex itejbu l-proprjetajiet terapewtiċi tagħhom bħal:

Ħafna mard jista 'potenzjalment jiġi ttrattat billi tiġi inibita l-espressjoni tal-ġene. Għalhekk, id-disinn ta 'siRNA sintetiku għal użi terapewtiċi sar objettiv popolari ta' bosta kumpaniji bijofarmaċewtiċi.

Database dettaljata tal-modifika kimika kollha bħal din hija kkurata manwalment f'siRNAmod, database kkonsultata manwalment ta 'siRNAs modifikati kimikament li huma validati b'mod sperimentali.

Sorsi:

Tsai, CS Biomacromolecules: Introduzzjoni għall-istruttura, il-funzjoni u l-informatika. Wiley-Liss, 2007.

Whitehead, KA; Dahlman, JE; Langer, RS; Anderson, DĠ (2011). "Silencing or Stimulation? SiRNA Delivery u s-Sistema Immuni". Reviżjoni Annwali tal-Inġinerija Kimika u Bijomolekulari 2 : 77-96.

Alekseev OM, Richardson RT, Alekseev O, O'Rand MG (2009). "Analiżi tal-profili tal-espressjoni tal-ġeni fiċ-ċelloli HeLa bħala reazzjoni għal depressjoni żejda jew tnaqqis ta 'NASP fuq medda ta' siRNA". Bijoloġija Riproduttiva u Endokrinoloġija: 45.